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2019-10-12生命中心PI张强锋课题组利用深度学习人工智能算法分析单细胞ATAC-seq数据

生命中心 PI 张强锋课题组利用深度学习人工智能算法分析单细胞 ATAC-seq 数据 2019 年 10 月 8 日，生命中心 PI 张强锋课题组在《自然通讯》（ Nature Communications ）上发表题为“ SCALE 方法基于隐特征提取进行单细胞 ATAC-seq 数据分析”（ SCALE method for single-cell ATAC-seq analysis via latent feature extraction ）的学术文章。真核生物的染色质具有复杂的高级结构，由 DNA 一圈一圈缠绕在组蛋白上形成串珠式模型并进一步折叠聚集而成。基因的转录必须要将相应的染色质打开形成开放区域才能结合其他的转录调控因子。因此可以说染色质开发区域是基因组编码生命的窗口。单细胞 ATAC-seq （ Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing ）技术在单细胞层次上通过 Tn5 DNA 转座酶在开放染色质插入测序接头进行标记并测序，从而获取“高分辨“的单细胞精度的染色质开
2019-09-25王泽峰博士做客水木清华生命科学讲座讲述《从RNA剪接角度理解生物多样性》

王泽峰博士做客水木清华生命科学讲座讲述《从 RNA 剪接角度理解生物多样性》 2019年9月20日上午，计算生物学研究所的所长王泽峰博士做客清华大学水木清华生命科学讲座，于清华大学生命新馆143报告厅作了题为“Increasing Coding Complexity of Human Genome at RNA Level”的精彩报告。来自生命学院、医学院及其他相关院系的师生现场聆听了报告，报告由生命科学学院PI鲁志博士主持。报告开始，王泽峰博士用原核生物和真核生物之间的对比点明，与单细胞生物相比，人类并没有表现出过分的基因水平的复杂度，由此引出RNA编辑对于提高基因表达多样性的作用。其中最具有代表性的当属RNA剪接（RNA splicing）。王泽峰博士表示，今年来关于RNA反式剪接产生circRNA的研究是对于RNA编辑多样性理解的一个新的方向。图为王泽峰博士讲座现场报告中，王泽峰博士主要介绍了RNA剪接方面的两个研究热点。第一部分是RNA的选择性
2019-09-11解放军总医院分子免疫学研究室-生物治疗病区主任韩为东教授做客水木清华讲解肿瘤临床免疫治疗现状与前景

解放军总医院分子免疫学研究室-生物治疗病区主任韩为东教授做客水木清华讲解肿瘤临床免疫治疗现状与前景 2019年9月5日下午，解放军总医院分子免疫学研究室-生物治疗病区主任韩为东教授在医学院会议室B323为医学院的广大师生做了《肿瘤临床免疫治疗现状与前景》的报告。来自清华大学医学院和生命学院的众多师生参与了这次报告，报告由清华大学医学院胡小玉教授主持。报告初始，韩教授介绍了临床免疫治疗的国际国内研究现状，特别是已经进入临床实验的新的免疫疗法研究进展。从获得2018年诺贝尔医学奖的CTLA4分子研究说起，谈到最近大热的针对PD1/PDL1分子的免疫治疗进展，以及CAR-T细胞治疗在临床治疗中的应用。但现今的免疫治疗方法并不能适用于所有肿瘤治疗，相关研究仍然任重道远。韩教授课题组针对抗PD1/PDL1的免疫治疗缺点，开发了DNA甲基化抑制剂地西他滨联合抗PD1/PDL1免疫力疗法（DP疗法），在临床应用中得到了非常好的疗效。报告中，
2019-08-30生命中心邹鹏入选2019年度C&EN Talented 12

生命中心邹鹏入选 2019 年度 C&EN Talented 12 2019 年 8 月 25 日，美国化学会 (ACS) 旗下全球化学化工领域最有影响力的新闻杂志《化学与工程新闻》（ Chemical & Engineering News,C&EN ）公布了 2019 年入选 Talented 12 的青年科学家名单，北大 - 清华生命科学联合中心、北京大学化学与分子工程学院邹鹏研究员本年度入选该名单，这是此次 12 名入选者中唯一在亚洲地区从事科学研究工作的学者。邹鹏， 2007 年本科毕业于北京大学化学学院，获化学和物理学双学士学位。 2012 年获美国麻省理工学院化学系博士学位， 2013 年至 2015 年在哈佛大学化学与化学生物学系进行博士后工作， 2015 年 5 月起任北京大学化学学院特聘研究员，兼任北大 - 清华生命科学联合中心研究员和北京大学 IDG/ 麦戈文脑科学研究所成员。研究兴趣集中在化学神经生物学领域，致力于发展新型化学探针工具，在高时空分辨下研究细胞的结构、活性和功能。
2019-08-27南方医科大学校长黎孟枫教授做客水木清华讲座讲解Ras诱导的细胞衰老和自噬及其克服机制

南方医科大学校长黎孟枫教授做客水木清华讲座讲解Ras诱导的细胞衰老和自噬及其克服机制 2019年8月22日下午，南方医科大学校长、“长江学者”特聘教授黎孟枫博士做客清华大学水木清华生命科学讲座，于清华大学医学科学楼B323报告厅作了题为“Ras-induced senescence and autophagy in lung cancer-molecular basis for targeted therapy of Ras-mutant cancers”的精彩报告。来自生命学院、医学院及其他相关院系的师生现场聆听了报告，报告由医学院PI郑撼球教授主持。图为黎孟枫校长讲座现场报告伊始，黎孟枫校长从临床上亟需解决的Ras突变的肺癌患者预后较差的问题入手，提出一个有趣的现象，Ras突变的细胞往往会产生自噬或衰老两种表型之一，但这与临床上Ras突变导致肿瘤发生的现象相矛盾。报告中，黎孟枫校长详细的介绍了持续激活的Ras如何导致细胞克服自噬及衰老的机制。首先，黎校长阐释了在Ras持续激活的肺癌细胞中,激酶
2019-08-182019年国家优青获得者出炉

2019年国家优青获得者出炉 8月16日，2019年国家自然科学基金评审结果正式揭晓，生命中心PI陈春来入选。国家自然科学基金委发布的公告表示，今年决定资助优秀青年科学基金项目600项，相比去年增加200项。根据统计，本年度共有来自196家单位的600位申请人入围国家优青，资助强度为120-130万元／项。从统计数据来看，清华大学和浙江大学共有24人，并列第一。南京大学共有21人，位列第三位。北京大学和上海交通大学各有19人，并列第四位。此外，中国科学技术大学、中山大学、华中科技大学、西安交通大学、北京航空航天大学、同济大学等高校入选申请人也较多，表现不俗。下面是各单位的立项数和2019年国家优青获得者名单：
2019-08-17生命中心陈鹏获颁“国际生物无机化学会早期职业奖”

生命中心陈鹏获颁“国际生物无机化学会早期职业奖” 2019年8月11日，在瑞士茵特拉根举办的第19届生物无机化学国际会议（ICBIC-19）的开幕式上，国际生物无机化学会现任主席Sue Berners-Price和前任主席Michael Hannon共同向生命中心、北京大学化学与分子工程学院陈鹏教授颁发 “国际生物无机化学会早期职业奖（Society of Biological Inorganic Chemistry Early Career Award）”，表彰他在金属离子生物信号转导和过渡金属催化的生物正交反应等方面的出色工作。开幕式结束后，陈鹏作了题为“过渡金属介导的蛋白质在体激活与信号转导调控”的大会报告。 SBIC Early Career Award于2007年设立，是国际生物无机化学会最重要的奖项，每年授予一位独立开展工作15年以内的杰出科学家，用以奖励其在化学（尤其是金属相关化学）与生命科学交叉领域的原创性成就，获奖者将在下一届生物无机化学国际会议期间参加颁奖仪式并做大
2019-08-12李毓龙、刘颖、沈晓骅、王初和朱听入选2019年国家自然科学基金委杰出青年基金

李毓龙、刘颖、沈晓骅、王初和朱听入选 2019 年国家自然科学基金委杰出青年基金 8 月 2 日，国家自然科学基金委员会根据《国家杰出青年科学基金项目管理办法》相关规定，对外公布了 2019 年度国家杰出青年科学基金建议资助项目申请人名单。此次全国共有 300 名学者入选，生命中心五位 PI ：李毓龙、刘颖、沈晓骅、王初及朱听名列其中。国家杰青基金支持在基础研究方面已取得突出成绩的青年学者自主选择研究方向开展创新研究，促进青年科学技术人才的成长，吸引海外人才，培养造就一批进入世界科技前沿的优秀学术带头人。
2019-08-12李毓龙、于翔获2019年张香桐神经科学青年科学家奖

李毓龙、于翔获 2019 年张香桐神经科学青年科学家奖据中国神经科学学会 6 月 4 号讯（ http://www.cns.org.cn/news/692.html ），生命中心、北京大学生命科学学院研究员李毓龙及于翔获 2019 年张香桐神经科学青年科学家奖。 “张香桐神经科学青年科学家奖” 是由张香桐基金会遵循张香桐先生尽力帮助我国神经科学发展、促进我国神经科学领域优秀人才成长的遗愿而设立的，每两年评审一次。自 2011 年起，张香桐基金会委托中国神经科学学会对奖项进行组织发布、评审、颁奖等事宜。截止至 2019 年 4 月底，共有 7 位候选人符合 “2019 年度张香桐神经科学青年科学家奖 ” 的申请要求。 5 月 12 日，中国神经科学学会在苏州组织并召开了 “2019 年度张香桐神经科学青年科学家奖 ” 评审会，邀请了 32 位评审专家以申请人发表学术论文为主要标准，对其进行了认真筛选和讨论。最后经无记名投票，评审出 2 位获奖者：分
2019-08-012019年生命科学联合中心第八届高中生物教师研修班成功举办

2019 年生命科学联合中心第八届高中生物教师研修班成功举办盛夏时节的清华园，山清水翠，桃李芬芳。 2019 年 7 月 21 日至 24 日，生命科学联合中心第八届全国高中生物教师暑期研修班在清华大学医学科学楼 B323 报告厅成功举办。由中国科学技术协会、生命科学联合中心推荐和选拔的来自全国各地的 89 名优秀中学生物教师参加了本次暑期研修班。 7 月 21 日上午，来自全国各地的生物教师们汇聚一堂，开启了为期四天的独特而又难忘的生命学科探索之旅。在开班典礼上，生命中心常务副主任、清华大学生命科学学院院长王宏伟教授对参加研修学习的中学教师们表示热烈的欢迎。王教授对生命中心的创立、历史、特色和发展予以介绍，并结合自己的研究领域阐述了结构生物学的发展历史、重大的科学意义和国内外的研究现状，使在座教师们全面了解结构生物学以及我国科学家在结构生物学领域所做出的重大
2019-07-27生命科学联合中心“结构生物学、化学生物学、药物化学”暑期班圆满结业

生命科学联合中心“结构生物学、化学生物学、药物化学”暑期班圆满结业 2019 年 7 月 15 日至 20 日，生命科学联合中心第八期“结构生物学、化学生物学、药物化学” 暑期班在清华大学医学科学楼 B323 报告厅顺利举行。本次暑期班共有来自全国各地高校 86 名本科生，以及各地中学 32 名高中生参与。暑期班充分发挥生命中心清华大学和北京大学两校师资与科研上的优势，延请知名学者，以激发学生兴趣、培育未来精英为目标，让学生在培训中了解领域内前沿问题，开拓思路，引导创新性的思维习惯。图为本次培训班合影 7 月 15 日上午的开班典礼上，生命中心常务副主任、清华大学生命科学学院院长王宏伟教授首先发表致辞。王院长讲到，当今生物学科发展迅速，现在的研究技术和条件都很成熟，清华大学的生物学科在自动化系、精仪系、航天航空学院等相关院系也有许多课题在开展。王院长向同学们生动地讲述了近 200 年生物学科的
2019-07-17生命中心2019“化学生物学”暑期培训圆满落幕

生命中心 2019 “化学生物学”暑期培训圆满落幕 2019 日 7 月 10 日，来自全国各地三十余所高校七十余名大学生怀着对化学生物学的热爱相聚于燕园，参加生命科学联合中心举办的化学生物学暑期培训班。此次培训于 7 月 10 日晚 5 点半在北京大学吕志和楼 B101 报告厅拉开帷幕，生命科学联合中心研究员陈鹏、伊成器、王初、邹鹏出席了开班仪式，他们以真挚、热情的致辞对同学们的到来表示欢迎。师生合影在自助餐和师生自由交流环节，同学们皆好奇地围在老师周围，七嘴八舌地向他们提问和请教，从求学生涯到科研方向。和蔼可亲又帅气的老师们也都非常亲切而耐心地为同学们答疑解惑。师生自由交流三天充实的讲座、小组讨论和参观，紧凑而又忙碌。三天中，来自北大、清华两校，包括伊成器、陈兴、刘志博、陈鹏、邹鹏、张永辉、贾桂芳、张文彬、王初、饶燏、罗佗平和
2019-07-17交叉碰撞激情，定量启发未来 --- 2019年生命中心“定量生物学”暑期培训成功举办

交叉碰撞激情，定量启发未来 --- 2019 年生命中心“定量生物学”暑期培训成功举办火热的夏日，一切都充满着生命的生息，一群有志于交叉生命科学研究的青年人汇聚于未名湖畔、交流于博雅塔下。 2019 年 7 月 6 日— 10 日，来自全国 30 余所高校以及 The University of Adelaide 的 60 名同学参加了生命科学联合中心举办的定量生物学暑期培训班。 7 月 6 日晚，培训班在吕志和楼 B101 教室正式拉开帷幕，全体同学以及 18 位助教参加开班仪式，生命中心和定量生物学中心研究员齐志、林一瀚、宋晨与魏平出席了开班式。（齐志主持开班仪式）开班仪式由齐志主持，他对同学们的到来表示热烈欢迎，并向为此次培训班付出辛苦工作的老师和工作人员表示了感谢，在齐志为大家简单介绍了生命科学联合中心以及北京大学定量生物学中心之后；魏平也为大家提出了三点人生建议：（ 1 ）确立好自己的方向；（ 2 ）做一个有勇气敲门的
2019-07-08生命中心成功举办第二次PI学术交流活动

生命中心成功举办第二次 PI 学术交流活动 6 月 26 日晚，生命中心 2019 年度第二次 PI 学术交流活动在北京大学吕志和楼三楼大厅举行，来自北大与清华两校近 70 名 PI 参加了本次学术交流。活动由生命中心 PI 李海涛主持。首先，张强锋做了题为“ Machine Intelligence for Structural Biology on DNA, RNA and Protein ”的报告，介绍了当前人工智能方法在现实世界尤其是生物领域中所取得的成就，指出其背后的主要方法正是深度神经网络与大数据。接下来他详细介绍了其实验室开发的机器学习算法在 DNA 、 RNA 以及蛋白结构解析及相关功能分析方面的三个方面的工作：一是结合变分自编码器和混合高斯模型的 single-cell ATAC-seq 分析工具（ SCALE ）。 SCALE 基于相同类群之间的细胞数据相近的假设，利用高斯混合模型来近似细胞类群分布，并利用变分自编码器的编码器有效提取特征和解码器恢复出增强的数据，且可以富集具有细胞类群特
2019-06-28生命中心PI王宏伟荣获“2019第二届中国冷冻电镜杰出贡献奖”

生命中心PI王宏伟荣获“2019第二届中国冷冻电镜杰出贡献奖” 评奖委员会成员美国文安德尔研究所李慧林教授代表评委会为王宏伟教授颁奖 “中国冷冻电镜杰出贡献奖”是由中国生物物理学会冷冻电子显微学分会（简称中国冷冻电镜分会）于2017年设立的。旨在奖励在冷冻电镜的方法学开发与应用方面获得重要突破、在中国冷冻电镜的重要设施建设与技术服务做出杰出贡献、在中国冷冻电镜的人才培养和推广中做出杰出贡献的国内科学家，以进一步推进中国冷冻电镜学科的发展，全面加强中国冷冻电镜的人才队伍建设。 2019年6月16 ~ 19日第六届全国冷冻电子显微学与结构生物学专题研讨会在北京密云顺利举办。本次研讨会由中国生物物理学会冷冻电子显微学分会主办，北京大学生命科学学院承办，中国电子显微镜学会低温电镜专业委员会协办。会议期间揭晓并举行了第二届“中国冷冻电镜杰出贡献奖”的颁奖活动，清华大学生命科学学院院长王宏
2019-06-28生命中心PI彭敏获2019年度“求是杰出青年学者奖”

生命中心PI彭敏获2019年度“求是杰出青年学者奖” 清华大学免疫学研究所彭敏研究员获2019年度“求是杰出青年学者奖”，“求是科技基金会”将于2019年9月21日（星期六）在北京清华大学举行隆重颁奖典礼。 “求是科技基金会”由查济民先生及家族于1994年在香港创立，基金会的主要目的是通过奖助在科技领域有成就的中国学者，推动中国科技研究工作的发展。1994年至2018年，共有336位在数学、物理、化学及生物医学等科技领域的中国科学家荣获基金会奖励，其中“求是终身成就奖”1位，“杰出科学家奖”29位、“杰出青年学者奖”180位、以及 “杰出科技成就集体奖”126位。彭敏研究员在免疫代谢和营养信号转导方面进行了深入的研究，在这些领域取得重要成果，发现多种调控营养信号转导的关键分子以及代谢通路调控免疫细胞分化的分子机制，为免疫相关疾病的发病机理与治疗提供了新的思路，这些研究成果发表在Cell，Nature及Science等国
2019-06-11朱卫国教授做客水木清华生命科学讲座《DNA损伤反应过程中的组蛋白修饰》

朱卫国教授做客水木清华生命科学讲座《 DNA 损伤反应过程中的组蛋白修饰》 2019 年 6 月 6 日下午，清华大学生命联合中心承办的第 78 期水木清华生命科学讲座在清华大学医学科学楼 D326 报告厅举行。深圳大学深圳大学特聘教授，医学部主任，国家自然科学基金创新群体首席科学家，国家杰出青年基金获得者，国家重点研发计划首席科学家，广东省基因组稳定性与疾病防治重点实验室主任朱卫国老师为广大师生做了题为《 DNA 损伤反应过程中的组蛋白修饰》的精彩报告。几十位来自清华大学生命学院、医学院、药学院及其他校内外单位的师生现场聆听了报告，报告由医学院常智杰老师主持。朱卫国教授讲座现场报告开始，朱教授首先介绍了表观遗传学的基本知识，并对过往的科学研究成果进行了总结。然后，朱教授分享了其团队近年发表的两篇文章。首先，朱教授介绍名为 G9a/GLP 的异源蛋白二聚体及它们在 DNA 损伤修
2019-05-27林圣彩教授做客水木清华生命科学讲座系列讲述《Towards a panoramic view of AMPK activation – glucose sensing and...

林圣彩教授做客水木清华生命科学讲座系列讲述《 Towards a panoramic view of AMPK activation –glucose sensing and implications 》 2019 年 5 月 23 日下午，清华大学生命科学联合中心主办的第 77 期水木清华生命科学讲座在清华大学医学科学楼 B323 进行。厦门大学生命科学学院、教育部 “ 长江学者奖励计划 ” 特聘教授林圣彩老师做客讲座，为广大师生们带来了题为《 Towards a panoramic view of AMPK activation –glucose sensing and implications 》的精彩讲座。报告会由药学院陈立功研究员主持。林圣彩教授讲座现场近年来，林圣彩教授以细胞代谢稳态调控为研究核心，针对细胞对营养物质与能量的感知机制以及代谢紊乱相关疾病的发生发展的分子机制进行研究，并取得了一系列原创性成果。首先，林教授以细胞如何精确调控合成代谢和分解代谢的问题，引出了参与细胞抑
2019-05-10刘耀光院士做客水木清华生命科学讲座系列讲述《杂交稻育性控制的分子遗传基础》

刘耀光院士做客水木清华生命科学讲座系列讲述《杂交稻育性控制的分子遗传基础》 2019年5月9日下午，清华大学生命科学联合中心承办的第76期水木清华生命科学讲座系列在清华大学医学科学楼B323报告厅举行。中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光老师为师生们做了题为《杂交稻育性控制的分子遗传基础》的精彩报告，详细介绍了水稻细胞质雄性不育与恢复性的分子机理与线粒体不育基因的起源进化核分子作用机制。报告由生命科学联合中心戚益军教授主持。刘耀光教授以水稻育种的技术发展为背景，介绍了以野生稻为起源，经历高秆农家稻、半矮秆水稻到杂交稻的育种过程，对利用细胞质雄性不育与恢复性（CMS/RF）的三系杂交水稻育种技术和利用核基因控制的光温敏不育性（PGMS/TGMS）的二系杂交水稻技术做了详细的阐述。刘耀光院士做学术报告报告中，刘耀光教授详细地介绍了线粒体基因与细胞核基因互作
2019-04-27秦樾教授做客水木清华生命科学讲座系列讲述《Acetylation and deacetylation in epigenetic signaling，why lysine h...

秦樾教授做客水木清华生命科学讲座系列讲述《 Acetylation and deacetylation in epigenetic signaling ， why lysine has so many PTMs? 》 2019年4月25日下午，苏州大学医学部主任秦樾教授在医学楼B323会议室为来自生命学院、医学院、药学院的广大师生做了《信号转导的磷酸化和乙酰化谁更关键》的生动有趣的报告。报告由清华大学医学院常智杰教授主持。报告伊始，秦教授问大家“有什么氨基酸只有一个密码子？”，就这样用一个看似简单的问题让现场气氛一下活跃起来。接下来秦樾教授详细介绍了蛋白质的多种翻译后修饰方式，以及肿瘤中蛋白质常发生的修饰形式。并以身边真实人物的癌症为例，为大家详细讲解了修饰后的蛋白质在肿瘤中产生的作用。秦樾教授做学术报告报告中，秦樾教授不仅给大家讲解了目前JAK-STAT信号通路的最新研究进展，以及STAT信号的发现历史和其中趣事，同时结合免疫

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