陈鹏研究组发展新一代蛋白质光交联探针

位点特异性的蛋白质光交联探针已经成为研究活细胞内蛋白质-蛋白质相互作用的关键工具。陈鹏课题组长期致力于发展基于遗传密码子拓展的蛋白质光交联技术。在之前的工作中他们设计了高效的光敏感非天然氨基酸交联探针（DiZPK），能够广泛地用于捕捉活细胞内的蛋白-蛋白相互作用。（Nat. Chem. Biol., 2011, 7, 671-677; J. Am. Chem. Soc., 2011, 133, 20581-20587.）

最近，在上述工作的基础之上，该课题组发展了“可切割”的新一代光交联探针DiZSeK（下图）。与原有探针相比，新一代的探针在高效捕捉蛋白相互作用的同时，其骨架中所含的硒原子能够在过氧化氢氧化条件下断裂，从而实现对光交联获得的“诱饵蛋白-靶标蛋白”复合物的分离。进一步的，他们发展了能够与靶标蛋白上产生的次硒酸基团发生特异反应的捕获试剂，实现了对靶标蛋白的特异标记和富集。上述新技术的发展，使他们在后续二维凝胶电泳实验中有效去除了诱饵蛋白的干扰，完成了对特定蛋白的全细胞靶标蛋白的质谱分析与鉴定。新一代“可切割型”光交联探针的开发，将有力地推动基于蛋白质光交联技术的蛋白质组学研究。该工作近日在美国化学会志上发表(Lin SX, et al, J. Am. Chem. Soc. 2014, DOI10.1021/ja504371w)。该文第一作者林世贤同学刚刚获得北京大学2014年优秀博士学位论文。此项研究得到了国家自然科学基金委、科技部和北大-清华生命科学联合中心的资助。

原文链接：http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja504371w