周岳课题组通过遗传学和多组学方法综合分析了EMF1蛋白在全基因组的结合特性及emf1突变体的三维结构变化。研究结果显示,EMF1结合于CD边界并维持了拟南芥染色质三维结构的稳定性。在emf1突变体中,H3K4me3、H3K27me3和H3K9me2 CD边界强度均有明显下降。随后,本研究综合分析了组蛋白修饰、EMF1结合位点以及emf1突变体中的结构变化,证明EMF1作为边界蛋白既可以独立于上述三种修饰调控染色质三维结构,也可以和H3K27me3或H3K9me2协同作用于三维基因组的稳定性。在染色质环层面,EMF1维持CD内部染色质环的相互作用强度并间接阻隔了异常长距离相互作用的形成。
此外,本研究发现拟南芥cohesin复合体SCC3亚基和EMF1存在直接相互作用。借助基因组学实验,本研究证明了拟南芥中cohesin复合体结合在CD边界并与EMF1在全基因组范围内共定位。结合信号峰的富集情况和基序富集分析发现,EMF1和SCC3的结合位点中均显著富集G-box基序,这暗示着EMF1可能被cohesin招募到特异位点并共同发挥作用。另外,通过RNAi技术,本研究发现当cohesin复合体无法正常发挥功能时,拟南芥CD边界强度也出现明显下降。这些结果均表明,EMF1与cohesin共同维持拟南芥染色质高级结构的稳定性。