接着，研究者对筛选出的功能性位点进行深入分析，特别关注磷酸化修饰。结果显示，677个筛选到的位点可能通过磷酸化修饰影响细胞生长，其中绝大多数为之前未知的功能性磷酸化位点（图2）。进一步研究表明，一些位点突变通过调节磷酸化水平导致信号通路异常，如MAPK信号通路中的MAPKAPK2 T338A突变以及MAP2K1 Y130H和S194P突变，影响了细胞的生长。

图2 筛选鉴定出大量功能性磷酸化位点

此外，研究者还分析了突变在蛋白质结构中的分布，发现丝氨酸到脯氨酸的替换广泛影响不同类型的蛋白质结构域功能，尤其是WD重复结构域中的两个高度保守的丝氨酸，暗示这些位点在维持蛋白质结构方面具有关键作用。

最后，研究发现，筛选出的促进细胞生长的突变与临床癌症患者的基因数据存在高度关联性（图3）。由于RPE1细胞系是永生化的正常细胞系，得到的309个可促进细胞生长的突变均可能为潜在的癌症驱动突变。据此猜想，研究者选择了MAP4K4-Y210C进行了体外克隆形成和小鼠体内成瘤实验，结果均证实了MAP4K4-Y210作为癌症驱动突变的潜力。

图3 与癌症临床数据相关的正向富集氨基酸位点

总体而言，该研究绘制了人类蛋白组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能图谱，揭示了这些位点与磷酸化修饰、蛋白质结构维持及癌症相关突变的密切联系，为生物学机制研究和临床应用提供了重要指导（图4）。

图4 研究总结示意图

魏文胜

北京大学生命科学学院 教授

北大-清华生命科学联合中心 PI

参考文献：

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