AIM平台由RNA靶向的dCas13蛋白、单链RNA脱氨酶TadA，以及特殊设计的可成环向导RNA（loop-forming gRNA，LF-gRNA）组成。LF-gRNA能够在目标RNA上诱导形成一个局部单链的“环区”，使其中的碱基充分暴露，成为单链脱氨酶作用的有效底物；同时，环区两侧由LF-gRNA与靶RNA互补配对形成双链结构，可有效阻止非目标位点的编辑。通过改变LF-gRNA诱导的单链环区的大小，可以实现对RNA编辑窗口尺寸的灵活且可控调节。

图1. AIM技术示意图

为拓展AIM平台的编辑能力，研究团队对脱氨酶TadA进行了蛋白质理性设计并获得一系列TadA变体，构建了三类具有不同功能的AIM系统： AIM-A / AIM-Amax（A-to-I编辑）；AIM-C / AIM-Cmax，（C-to-U编辑）；以及AIM-A&C / AIM-A&Cmax（同时实现A与C的编辑）。

依托AIM平台“多位点、多功能”的编辑特性，研究团队完成了现有RNA编辑工具难以实现的应用。首先，AIM的多位点编辑能力在提前终止密码子UAA的通读中展现出独特优势。利用AIM-Amax系统，研究团队成功在同一密码子内实现两个A碱基的同时编辑，从而在多个转录本上实现了UAA提前终止密码子的通读。随后，在囊性纤维化细胞模型以及杜氏肌营养不良小鼠模型中，研究团队检测到全长蛋白表达和功能恢复，展示了AIM平台在疾病治疗方面的应用潜力。此外，研究团队还将AIM应用于操纵与蛋白翻译后修饰相关的RNA信息。蛋白质翻译后修饰具有动态性和可逆性，这一特点使其成为通过RNA编辑工具进行功能干预的理想对象。研究团队利用AIM在RNA水平对单个或相邻的关键磷酸化相关密码子进行改写，从而实现对蛋白质稳定性的调控。

图2. AIM在RNA信息操纵中的应用

北京大学生命科学学院、基因功能研究与操控全国重点实验室、核糖核酸北京研究中心、北大-清华生命科学联合中心伊成器教授为该论文的通讯作者。北京大学生命科学学院博士后庄元、北京大学生命科学学院博士研究生朱擎国（2022级）、北京大学前沿交叉学院博士研究生乌浩（2020级）和林湘玥（2022级）是本论文的共同第一作者。该研究得到了国家自然科学基金委、北京市科学技术委员会、中国农业农村部、新基石科学基金会和核糖核酸北京研究中心的资助。国家蛋白质科学基础设施-北京基地北大分中心为该研究提供了重要支持。

伊成器

北京大学生命科学学院教授

北大-清华生命科学联合中心PI