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林一瀚

       

林一瀚

 

电子邮件:yihan.lin(at)pku(dot)edu(dot)cn

研究领域:定量单细胞生物学、系统与合成生物学

通讯网址:北京市海淀区颐和园路5号北京大学王克桢楼420 100871

  

研究方向: 

林一瀚实验室从事定量单细胞生物学、系统与合成生物学研究。作为一门许多世界知名大学纷纷建立的交叉型学科,定量生物学结合了生物、物理、数学等学科,在诸多前沿的生物学领域得到了广泛应用,对揭示各种细胞过程的基因调控机制以及人类疾病的致病机理等方面起到了不可或缺的作用。
本实验室的研究着重于在单细胞水平上定量解析疾病、免疫等重要过程中的基因调控机制和调控网络,并利用合成生物器件对这些过程实施精准干扰或控制。研究从以下几个方面展开:动态基因调控网络的功能和设计原理;表观遗传学、转录因子动力学等机制对肿瘤、免疫细胞的命运决策及细胞异质性的调控;新型合成生物学器件的设计和应用。
实验室致力于开展前沿的交叉学科研究,有机结合了包括系统生物学、合成生物学、定量单细胞分析、活细胞时序荧光成像、数学建模等研究方法。同时,为了引领单细胞研究领域,实验室正在研发高通量、高时空分辨率的单细胞分析工具,用于解析疾病、免疫过程中的基因调控网络,并为单细胞水平上药物筛选及大规模测试合成生物学器件等应用提供新平台。

 

代表性科研论文: 

• Lin, Y. & Elowitz, M. B., (2016). “Central dogma goes digital”, Molecular Cell 61, 791-792
• Lin, Y., Sohn, C., Dalal, C. K., Cai, L., & Elowitz, M. B., (2015). “Combinatorial gene regulation by modulation of relative pulse timing”, Nature 527 (7576): 54-58. (Article)
• Levine, J. H.*, Lin, Y.*, & Elowitz, M. B., (2013). “Functional roles of pulsing in genetic circuits”, Science 342(6163): 1193-1200. (* equal contribution)
• Lin, Y., Li, Y., Crosson, S., Dinner, A.R., & Scherer, N.F., (2012). “Phase resetting reveals network dynamics underlying a bacterial cell cycle”, PLoS Computational Biology 8(11): e1002778. doi:10.1371/journal.pcbi.1002778.
• Lin, Y., Crosson, S., & Scherer, N.F., (2010). “Single-gene tuning of Caulobacter cell cycle period and noise, swarming motility, and surface adhesion”, Molecular Systems Biology, 6: p. 445.
• Lin, Y., Zhao, T., Jian, X., Farooqui, Z., Qu, X., He, C., Dinner, A.R., & Scherer, N.F., (2009). “Using the bias from flow to elucidate single DNA repair protein sliding and interactions with DNA”, Biophysical Journal, 96: 1911-1917.

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