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林杰

 

 

林杰

 (2020年11月加入生命中心)

 

电子邮: jielinphysics@gmail.com

 

研究方向: 
 
我的主要研究方向是理论生物物理(theoretical biological physics),也就是通过物理的语言去描述和理解复杂生物系统。我关注的对象通常是生物系统中被广泛观察到的现象。这些现象可以普遍存在于不同物种,甚至不同生物域(domains)中。近期关注的问题包括基因表达(gene expression)的普适规律,细胞大小的调控(cell size regulation)和微生物的进化过程(microbial evolution)等。通常我的研究目标是构建一个统一的数学模型去理解那些现象,同时能够做出新的可以被实验验证的理论预言。

 

构建一个描述生物系统的数学模型是具有挑战性的,因为这个模型必须抓住问题的关键元素,并且摒弃无关的细节。在凝聚态物理里面,找到这样的关键变量通常不是很困难,因为被研究的系统在空间上经常是足够均匀的。然而,在生物系统里,被研究的对象往往要复杂得多且是非常不均匀的(想象一下有各种细胞器且充满各种各样生物分子的真核细胞)。因此,想要在生物系统中找到问题的关键变量经常不是显而易见的,甚至是需要物理直觉的。对于物理学家来说,这或许是生物物理这门交叉学科最有趣的地方。
 

代表性论文:

 

1. Evolution of microbial growth traits under serial dilution, Jie Lin, Michal Manhart, Ariel Amir, Genetics, in press, 2020

2. Optimal segregation of proteins: phase transitions and symmetry breaking, Jie Lin, Jiseon Min, Ariel Amir, Physical Review Letters, 122, 068101, 2019               

3. Homeostasis of protein and mRNA concentrations in growing cells, Jie Lin, Ariel Amir, Nature Communications, 9, 4496, 2018

4. Modeling cell size regulation: From single-cell level statistics to molecular mechanisms and population-level effects, Po-Yi Ho, Jie Lin, Ariel Amir, Annual Review of Biophysics, 47, 2018

5. The effects of stochasticity at the single-cell level and cell size control on the population growthJie Lin, Ariel AmirCell Systems5(4):358-3672017

6. Evidence for marginal stability in emulsionsJie Lin, Ivane Jorjadze, Lea-Laetitia Pontani, Matthieu Wyart, and Jasna Brujic , Physical Review Letters, 117, 208001, 2016

7. Mean-field description of plasticity in amorphous solids, Jie Lin, Matthieu Wyart, Physical Review X, 6, 011005, 2016

8. Criticality in the approach to failure in granular materials and amorphous solids, Jie Lin, Thomas Gueudre, Alberto Rosso, Matthieu Wyart, Physical Review Letters, 115, 168001, 2015

9. Scaling description of the yielding transition in soft amorphous solids at zero temperature, Jie Lin, Edan Lerner, Alberto Rosso, Matthieu WyartProceedings of the National Academy of Sciences, 111 (40) 14382-14387, 2014

10. On the density of shear transformation zones in amorphous solids, Jie Lin, Alaa Sadde, Edan Lerner, Alberto Rosso, Matthieu Wyart, EPL (Europhysics Letters), 105, 26003, 2014

 

 

 

 

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